龙岗建设网站,dw可以做网站吗,网站 建设 问题,免费1级做爰片观看网站在线视频竞争风险模型就是指在临床事件中出现和它竞争的结局事件#xff0c;这是事件会导致原有结局的改变#xff0c;因此叫做竞争风险模型。比如我们想观察患者肿瘤的复发情况#xff0c;但是患者在观察期突然车祸死亡#xff0c;或者因其他疾病死亡#xff0c;这样我们就观察不…竞争风险模型就是指在临床事件中出现和它竞争的结局事件这是事件会导致原有结局的改变因此叫做竞争风险模型。比如我们想观察患者肿瘤的复发情况但是患者在观察期突然车祸死亡或者因其他疾病死亡这样我们就观察不到复发情况了这种情况下不能把缺失数据仅仅当做右删失处理这样的话会造成数据的估值错误。这是我们应该优先选择竞争风险模型来做数据分析而不是COX回归。竞争风险模型在数据挖掘中经常使用到。既往我们在文章《手把手教你使用R语言做竞争风险模型并绘制列线图》和《一步到位手把手教你R语言竞争风险模型建模-列线图-校准曲线-K折验证-外部验证- 决策曲线》已经介绍了使用cmprsk包绘制和QHScrnomo包进行分析今天咱们来介绍一下tidycmprsk包它也是基于cmprsk包进行分析但是功能更多绘制图形更加精美。 下面立即开始先导入数据和R包使用的是tidycmprsk 包自带的trial数据
library(tidycmprsk)
data(trial)这是一个模拟两种化疗药物的模拟治疗肿瘤的数据数据集包含200名接受药物A或药物B的患者的基线特征。数据集还包含肿瘤对治疗的反应结果。 Trt化疗的药物age年龄marker标记物水平stage阶段grade等级response物流反应death_cr死亡状态这个是结局变量ttdeath时间变量
假设咱们想研究trt不同化疗药物对结局的影响咱们先来个单因素的分析
out-cuminc(Surv(ttdeath, death_cr) ~ trt, trial)
out咱们可以进一步绘图如果没有指定一般是默认第一个结局
out %%ggcuminc()咱们也可以进一步指定这样清楚一点
out %%ggcuminc(outcome c(death from cancer, death other causes))加上生存分析人数的表格
out %%ggcuminc(outcome c(death from cancer)) add_risktable()也可以换个格式显示
out %%ggcuminc(outcome c(death from cancer)) add_risktable(risktable_stats n.risk,stats_label list(n.risk Number at Risk),)还可以进一步绘制可信区间
out %%ggcuminc(outcome c(death from cancer)) add_risktable(risktable_stats n.risk,stats_label list(n.risk Number at Risk),) add_confidence_interval()接下来咱们来演示多因素分析如果你不指定结局的话会默认的把第一个结局当成存活最后一个结局当成竞争风险指标就是咱们常见的0,1,2形式
crr_mod - crr(Surv(ttdeath, death_cr) ~ age trt, trial)
crr_mod如上图结果就出来了结果还表明了选择了癌症为结局。我们也可以指定我觉得这样比较好点使用failcode这个参数指定
crr_mod - crr(Surv(ttdeath, death_cr) ~ age trt, failcodedeath from cancer,trial)
crr_mod结果表明药物B相比药物A并没有明显优势。
