西安网站设计锦,企业网站优化服务主要围绕哪些要素,网店运营ppt,获得网站php管理员密码使用bwa将样本fastq文件比对到线粒体参考基因组， 并使用bcftools进行call变异。
基础软件安装
conda install bcftools -y
conda install samtools-y
conda install bwa -y一、Call人类线粒体变异
1. 构建线粒体参考基因组
参考基因组： 人类线粒体参考基因组NC_012920.1 …使用bwa将样本fastq文件比对到线粒体参考基因组， 并使用bcftools进行call变异。
基础软件安装
conda install bcftools -y
conda install samtools-y
conda install bwa -y一、Call人类线粒体变异
1. 构建线粒体参考基因组
参考基因组： 人类线粒体参考基因组NC_012920.1
# NCBI下载参考基因组fasta序列, 重命名为mt.fasta
mv NC_012920.1.MT.fasta mt.fastabwa index mt.fasta
# 生成一下5个文件
# mt.fasta.amb mt.fasta.ann mt.fasta.bwt mt.fasta.pac mt.fasta.sasamtools faidx mt.fasta
# 生成mt.fasta.
